69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_14174 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  100 
 
 
405 aa  818    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  25.85 
 
 
583 aa  141  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  28.18 
 
 
424 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.94 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  25.14 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  24.93 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  23.88 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  23.3 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 
451 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  28.25 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  27.09 
 
 
438 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  25.63 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  26.86 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.59 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  25.53 
 
 
210 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  18.72 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
429 aa  53.5  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
446 aa  53.5  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  24.78 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  25.68 
 
 
500 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  25.68 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  25 
 
 
500 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0053  major facilitator transporter  33.04 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000090495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
460 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  33.98 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.94 
 
 
432 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  27.06 
 
 
502 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  30.97 
 
 
493 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2780  proline/glycine betaine transporter  24.44 
 
 
501 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  25 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  30.1 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  24.19 
 
 
500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  24.22 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  23.53 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  23.87 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  23.87 
 
 
500 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  24.22 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  24.22 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  24.22 
 
 
500 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
457 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0893  major facilitator superfamily permease  29.91 
 
 
450 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  25 
 
 
500 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  23.59 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4131  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.43 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4056  major facilitator transporter  29.46 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 
459 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  25.81 
 
 
505 aa  43.9  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0994  major facilitator superfamily permease  29.91 
 
 
450 aa  43.9  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.211502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0087  major facilitator transporter  31.25 
 
 
457 aa  43.5  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
409 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  18.61 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  28.95 
 
 
510 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1177  major facilitator transporter  27.07 
 
 
399 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.670552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 
435 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>