124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4281 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  819    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  58.7 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  50.84 
 
 		 438 aa  342  5e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  47.94 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 425 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  36.67 
 
 		 426 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 419 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 443 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  34.4 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  36.62 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 451 aa  156  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 440 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  28.65 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  28.86 
 
 		 405 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  25.98 
 
 		 545 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.09 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  27.69 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45818  predicted protein  27.56 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0729495  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01510  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  30.23 
 
 		 507 aa  53.1  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1089  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 509 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  27.8 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 518 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 530 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0467  general substrate transporter  25.62 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000495817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 457 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  26.67 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2914  proline/glycine betaine transporter  24.32 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.839203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2777  proline/glycine betaine transporter  24.32 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.426081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0864  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 441 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  23.05 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  23.05 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  27.56 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  23.05 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  23.05 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  23.05 
 
 		 500 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  31.45 
 
 		 510 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  29.02 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  23.02 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4087  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  22.74 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4636  proline/glycine betaine transporter  23.4 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4636  proline/glycine betaine transporter  23.4 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4545  proline/glycine betaine transporter  23.4 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4552  proline/glycine betaine transporter  23.4 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  36.17 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 463 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 551 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  36.17 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  35.11 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 466 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  23.05 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  23.05 
 
 		 500 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  28.83 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2869  proline/glycine betaine transporter  22.26 
 
 		 500 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  26.26 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  27 
 
 		 468 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1500  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2112  proline/glycine betaine transporter  22.78 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  34.04 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  32.52 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0108  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  36.96 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  26.62 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02413  sugar transporter  29.82 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  54.29 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  54.29 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1420  proline/glycine betaine transporter  21.93 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00160587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  30.56 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>