78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1831 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  100 
 
 		 430 aa  852    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.63 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  24.94 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.57 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.62 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  28.21 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  22.07 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.06 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.3 
 
 		 460 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.3 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  21.48 
 
 		 475 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  22.39 
 
 		 625 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.36 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.01 
 
 		 544 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.48 
 
 		 463 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 421 aa  53.5  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.59 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.48 
 
 		 475 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.93 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 460 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  23.69 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.25 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.7 
 
 		 443 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  21.48 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  23.4 
 
 		 524 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  23.53 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.97 
 
 		 552 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.97 
 
 		 552 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 443 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.14 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.17 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.14 
 
 		 441 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.72 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.72 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.59 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.39 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  23.08 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.73 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.49 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  24.15 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  24.69 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.4 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  26.04 
 
 		 479 aa  45.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  25.76 
 
 		 467 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  20.29 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.91 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  25.68 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.76 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2441  transporter, putative  27.35 
 
 		 453 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0973262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.02 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  21.65 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.46 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  24.48 
 
 		 481 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.4 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 523 aa  43.5  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  31 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  24.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  24.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  24.48 
 
 		 473 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.36 
 
 		 469 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>