72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1065 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  811    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 433 aa  106  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 431 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 450 aa  95.9  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  19.07 
 
 		 402 aa  94  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 440 aa  90.9  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  24.3 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  27.76 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  25.46 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  21.65 
 
 		 450 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  23.89 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  24.8 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  23.45 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.74 
 
 		 474 aa  57  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.37 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 495 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  24.41 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 470 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  19.9 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 531 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  27.51 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  27.19 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 471 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 		 471 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0798  transporter, putative  30 
 
 		 442 aa  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.53 
 
 		 491 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  24.79 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  23.3 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  22.07 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23.75 
 
 		 490 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06034  hypothetical protein  29.27 
 
 		 360 aa  43.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>