13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0654 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  100 
 
 		 399 aa  771    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0999  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0123393 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1313  hypothetical protein  26.35 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.733203  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.22 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1702  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.214496  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01889  sugar transporter  25 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.660327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>