16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4675 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4675  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
411 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0999  major facilitator transporter  43.04 
 
 
390 aa  263  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0123393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0654  major facilitator transporter  34.95 
 
 
399 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0842351 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  26.42 
 
 
416 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1599  major facilitator transporter  28.92 
 
 
421 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1313  hypothetical protein  35.59 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.733203  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1406  major facilitator transporter  23.84 
 
 
401 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1702  major facilitator transporter  23.93 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.214496  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  22.25 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3810  major facilitator transporter  30.41 
 
 
394 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0975  hypothetical protein  24.14 
 
 
498 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.798408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  25.53 
 
 
501 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.3 
 
 
543 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  20.49 
 
 
406 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5086  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
457 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0501179  normal  0.911731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>