253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2711 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
442 aa  870    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  30.18 
 
 
439 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  25.4 
 
 
475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  25.56 
 
 
444 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.91 
 
 
469 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  24.28 
 
 
460 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.13 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.88 
 
 
460 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.07 
 
 
457 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 
475 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.64 
 
 
460 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  25.11 
 
 
454 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.39 
 
 
471 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.54 
 
 
442 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.14 
 
 
442 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.43 
 
 
441 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.38 
 
 
441 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.14 
 
 
441 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  27.61 
 
 
479 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.87 
 
 
442 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.27 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  27.27 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  27.27 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  27.27 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  27.27 
 
 
479 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  27.27 
 
 
460 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.76 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  29.13 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  29.13 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  29.13 
 
 
460 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  29.13 
 
 
460 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  26.94 
 
 
460 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  26.94 
 
 
460 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.72 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.71 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.25 
 
 
544 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  29.53 
 
 
464 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.15 
 
 
461 aa  90.5  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  26.56 
 
 
442 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  22.69 
 
 
461 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.09 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.06 
 
 
445 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.22 
 
 
444 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  22.22 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.56 
 
 
465 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.22 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  28.35 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.22 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.22 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.8 
 
 
445 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.2 
 
 
444 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.93 
 
 
459 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  24.36 
 
 
472 aa  83.2  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.93 
 
 
460 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.63 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.02 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  23.83 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.35 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.02 
 
 
478 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.33 
 
 
477 aa  79.7  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.15 
 
 
472 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.3 
 
 
481 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  23.81 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.3 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.77 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.89 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.1 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.05 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  37.1 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.93 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.62 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1831  major facilitator transporter  24.86 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.612991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.07 
 
 
471 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  27.65 
 
 
472 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.27 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  23.08 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  28.84 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  21.25 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0907  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  25 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000225717  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.42 
 
 
466 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  23.5 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  26.96 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  22.19 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.57 
 
 
480 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  22.22 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  22.87 
 
 
481 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.51 
 
 
472 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.76 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.81 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.81 
 
 
475 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  25 
 
 
625 aa  71.2  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  22.99 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  23.81 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  24.03 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  24.02 
 
 
466 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  24.02 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  23.4 
 
 
480 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>