197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1383 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1383  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
439 aa  861    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2711  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 
442 aa  318  9e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.309074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  25.29 
 
 
439 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  23.78 
 
 
454 aa  110  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  21.94 
 
 
460 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.69 
 
 
444 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  28.05 
 
 
475 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.23 
 
 
476 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.49 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26 
 
 
445 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.68 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.35 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.64 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.42 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.68 
 
 
544 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.38 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  24.46 
 
 
461 aa  73.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  27.12 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  24.3 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  28.21 
 
 
634 aa  70.1  0.00000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.89 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.95 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.82 
 
 
467 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.31 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  21.38 
 
 
448 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.14 
 
 
552 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  23.62 
 
 
464 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  35.14 
 
 
552 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  22.07 
 
 
448 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  25.1 
 
 
449 aa  64.7  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.04 
 
 
506 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  25.1 
 
 
442 aa  63.5  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  29.01 
 
 
480 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.09 
 
 
465 aa  62  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  21.19 
 
 
469 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  23.94 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  33.65 
 
 
468 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  21.85 
 
 
442 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  20.96 
 
 
448 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.33 
 
 
479 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  25.95 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  26.46 
 
 
465 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.82 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.99 
 
 
471 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1391  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  28.12 
 
 
461 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.58 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.41 
 
 
493 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.29 
 
 
463 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  26.39 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  20.64 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.04 
 
 
447 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25 
 
 
451 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.27 
 
 
443 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.04 
 
 
481 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  23.85 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  23.85 
 
 
466 aa  57  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  23.57 
 
 
625 aa  56.6  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.97 
 
 
472 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.2 
 
 
442 aa  56.6  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  23.35 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.1 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  30.28 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.04 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  30.82 
 
 
486 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.15 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  24.08 
 
 
467 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  24.15 
 
 
466 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.67 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.53 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.56 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  26.5 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.53 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.53 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.53 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.53 
 
 
468 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  23.08 
 
 
639 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.38 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.38 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  29.2 
 
 
459 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  23.56 
 
 
466 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.69 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.38 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.38 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.73 
 
 
480 aa  53.9  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.79 
 
 
465 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.78 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1309  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  25.49 
 
 
481 aa  52.8  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  22.32 
 
 
460 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  21.55 
 
 
462 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 
440 aa  52.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.59 
 
 
467 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0997  Na+/melibiose symporter and related transporters-like  28.48 
 
 
475 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.281913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.3 
 
 
442 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  21.88 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  23.05 
 
 
460 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  33.61 
 
 
485 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>