199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1893 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
440 aa  856    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  45.75 
 
 
468 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  39.24 
 
 
445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  39.04 
 
 
468 aa  229  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  32.05 
 
 
472 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.79 
 
 
436 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  33.33 
 
 
471 aa  203  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  32.27 
 
 
461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  30.09 
 
 
443 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  38.41 
 
 
407 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  32.2 
 
 
480 aa  190  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  36.68 
 
 
431 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  32.02 
 
 
506 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  31.86 
 
 
464 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  34.3 
 
 
452 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  35.39 
 
 
428 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  36.3 
 
 
514 aa  154  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  30.05 
 
 
453 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  35.14 
 
 
439 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 
439 aa  147  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  35.75 
 
 
445 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  32.51 
 
 
435 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  33.18 
 
 
453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  29.73 
 
 
463 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  31.86 
 
 
409 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  27.18 
 
 
461 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  34.63 
 
 
405 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  30.33 
 
 
412 aa  100  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  32.46 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  32.98 
 
 
401 aa  96.7  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  33.42 
 
 
401 aa  93.6  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.76 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.96 
 
 
475 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.06 
 
 
476 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  25.47 
 
 
439 aa  84  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  23.99 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.89 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  26.88 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 
475 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.66 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.06 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.43 
 
 
471 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.64 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  24.94 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.32 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  27.69 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.13 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  24.02 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.61 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  19.7 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.59 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.94 
 
 
527 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  19.7 
 
 
454 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.4 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.88 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  23.72 
 
 
472 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.81 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.2 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.81 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.81 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.85 
 
 
462 aa  65.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.81 
 
 
444 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  27.07 
 
 
455 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.6 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.8 
 
 
481 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.82 
 
 
471 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  23.39 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.84 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
523 aa  63.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  24.88 
 
 
443 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  23.35 
 
 
451 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 
475 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.46 
 
 
465 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.57 
 
 
471 aa  63.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  29.23 
 
 
459 aa  62.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.55 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.74 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.97 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.55 
 
 
478 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.57 
 
 
471 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  22.98 
 
 
462 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.37 
 
 
474 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  23.35 
 
 
467 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  24.04 
 
 
625 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.37 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.37 
 
 
474 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.41 
 
 
466 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3962  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
455 aa  60.1  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
444 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.36 
 
 
477 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  22.31 
 
 
448 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  24.54 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.49 
 
 
552 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  24.61 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  24.61 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  24.61 
 
 
473 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>