50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0410 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 405 aa  768    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  46.43 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  40.65 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  47.91 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 401 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  47.12 
 
 		 401 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  39.09 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  37.63 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  36.14 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  33.74 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  37.69 
 
 		 452 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  34.29 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  35.84 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  35.12 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  35.15 
 
 		 439 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 464 aa  123  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  36.27 
 
 		 514 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.05 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 472 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 471 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.8 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.7 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  26.67 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  21.99 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  27.02 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  25.61 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 506 aa  63.2  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 461 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.28 
 
 		 469 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.94 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  21.3 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  25.67 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  26.12 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1309  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  27.83 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2040  sugar/sodium symporter  23.77 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.84 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  24.68 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  23.9 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.23 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.58 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1193  Na+/xyloside symporter or related transporter  23.54 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.255847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>