39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2752 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  99 
 
 		 401 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  743    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  86.03 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  62.47 
 
 		 412 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  55.36 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  47.62 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  40.1 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  41.23 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  36.32 
 
 		 431 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  37.25 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  38.9 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  39.48 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  38.86 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  34.31 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  36.97 
 
 		 445 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.88 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 440 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  44.67 
 
 		 514 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  21.74 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 463 aa  76.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.83 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  22.51 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  21.77 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  25 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  22.71 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  20.3 
 
 		 448 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  23.72 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  24.44 
 
 		 451 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>