151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0517 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  100 
 
 
471 aa  917    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  36.93 
 
 
461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  39.04 
 
 
463 aa  255  9e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  32.13 
 
 
472 aa  227  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  32.81 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  32.38 
 
 
453 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  31.35 
 
 
480 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.76 
 
 
461 aa  163  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  30.8 
 
 
468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  27 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  28.26 
 
 
506 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  29.57 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  31.44 
 
 
457 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  31.67 
 
 
468 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.63 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.9 
 
 
436 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  23.39 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.39 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.86 
 
 
448 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.82 
 
 
442 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.99 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.22 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  24.95 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.62 
 
 
475 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.12 
 
 
442 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 
476 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  23.18 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.53 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  23.87 
 
 
461 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.53 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  24.63 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  24.63 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  24.63 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  24.63 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  23.53 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.82 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  24.88 
 
 
476 aa  67.8  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26 
 
 
444 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  24.71 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.59 
 
 
463 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.31 
 
 
441 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.82 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.75 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.67 
 
 
472 aa  64.7  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.75 
 
 
465 aa  63.2  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.88 
 
 
465 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  22.04 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  24.88 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  20.98 
 
 
469 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  21.73 
 
 
493 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.32 
 
 
477 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.24 
 
 
650 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.36 
 
 
497 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
460 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  24.87 
 
 
503 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  22.93 
 
 
467 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.48 
 
 
478 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  31.58 
 
 
514 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.24 
 
 
471 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  28.95 
 
 
522 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.04 
 
 
478 aa  56.6  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.59 
 
 
462 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  22.93 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  20.96 
 
 
448 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3707  sugar:cation symporter family protein  26.46 
 
 
511 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.97 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.97 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.97 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.94 
 
 
443 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  33.9 
 
 
479 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.97 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.97 
 
 
444 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  23.2 
 
 
466 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  22.92 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.28 
 
 
513 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  23.2 
 
 
466 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  32.14 
 
 
486 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.41 
 
 
465 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.41 
 
 
468 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  24.71 
 
 
634 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  23.41 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  26.21 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  23.41 
 
 
468 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  23.41 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  23.41 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  25.81 
 
 
485 aa  53.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.06 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  23.24 
 
 
511 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  22.93 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  23.17 
 
 
462 aa  51.2  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  26 
 
 
470 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  29.1 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.97 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.42 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.35 
 
 
471 aa  50.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  22.25 
 
 
459 aa  50.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.78 
 
 
481 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.02 
 
 
481 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22 
 
 
466 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>