168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1057 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  100 
 
 
514 aa  947    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  50.86 
 
 
407 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  40.48 
 
 
445 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  40.09 
 
 
468 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  45.68 
 
 
452 aa  230  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  40.52 
 
 
428 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  42.73 
 
 
439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  42.44 
 
 
439 aa  211  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.7 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  36.77 
 
 
436 aa  187  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  36.7 
 
 
431 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
440 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  53.44 
 
 
435 aa  168  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  30.4 
 
 
506 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  31.09 
 
 
471 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  29.1 
 
 
472 aa  151  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  26.52 
 
 
443 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  29.62 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  29.65 
 
 
461 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  37 
 
 
412 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  33.26 
 
 
409 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  36.47 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  39.03 
 
 
401 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  24.84 
 
 
480 aa  127  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  49.76 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  25.45 
 
 
453 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  29 
 
 
463 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  27.85 
 
 
461 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  44.67 
 
 
401 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  44.67 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  29.02 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.18 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
475 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  25.62 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  25.7 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  25.35 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.86 
 
 
460 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.05 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.67 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.35 
 
 
460 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  34.03 
 
 
444 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.96 
 
 
449 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.85 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  38.1 
 
 
453 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.96 
 
 
448 aa  64.3  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.15 
 
 
465 aa  63.9  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  29.54 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  23.24 
 
 
468 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.94 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  25.17 
 
 
443 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.47 
 
 
465 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  29.45 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  24.38 
 
 
467 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  29.45 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  29.45 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  29.45 
 
 
468 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.44 
 
 
451 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  20.61 
 
 
475 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
460 aa  60.1  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  23.91 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.88 
 
 
467 aa  60.1  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.11 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  23.91 
 
 
466 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.55 
 
 
544 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.56 
 
 
442 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.25 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  21 
 
 
439 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
495 aa  57.4  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4951  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide family  24.4 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.841107 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3908  sugar glycoside-pentoside-hexuronide family protein  23.67 
 
 
466 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.845629  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.1 
 
 
472 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  33.14 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  25.17 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.86 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.01 
 
 
448 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.3 
 
 
552 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.86 
 
 
441 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.86 
 
 
442 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.3 
 
 
552 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  31.94 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  24.01 
 
 
462 aa  55.5  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.97 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.87 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.86 
 
 
441 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.49 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.17 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.22 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  22.39 
 
 
472 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  26.5 
 
 
455 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.47 
 
 
481 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.51 
 
 
454 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  25.9 
 
 
508 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  29.45 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  22.33 
 
 
625 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.41 
 
 
481 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.04 
 
 
481 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  22.34 
 
 
508 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  22.34 
 
 
508 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  26.62 
 
 
508 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3275  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.01 
 
 
513 aa  50.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>