74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6100 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 431 aa  828    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  43.03 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  41.11 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 407 aa  206  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  38.29 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  38.05 
 
 		 439 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  40.53 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  34.67 
 
 		 468 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  38.71 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  33.71 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 440 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  35.68 
 
 		 409 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  34.53 
 
 		 412 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  34.34 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  35.34 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  35.31 
 
 		 401 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  31.36 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  22.8 
 
 		 443 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 472 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  41.94 
 
 		 514 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 463 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  29 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.68 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  25 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.98 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  36.6 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  25.83 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  25.09 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  23.59 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  27.57 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  23.73 
 
 		 472 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  25.99 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 420 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  22.88 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  22.19 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  25.85 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  28 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 505 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  27.92 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.76 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  22.39 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.8 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.35 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  22.58 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  22.17 
 
 		 460 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.75 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  20.8 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1019  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.25 
 
 		 473 aa  46.6  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  22.73 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 457 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  31.93 
 
 		 459 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.71 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.97 
 
 		 544 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  28.47 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.7 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  24.7 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  24.7 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  28.57 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  24.7 
 
 		 467 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.23 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  25.83 
 
 		 480 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>