253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1586 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  100 
 
 		 453 aa  864    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  38.85 
 
 		 468 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  35.09 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 472 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 480 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  34.08 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  29.17 
 
 		 443 aa  173  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  30.32 
 
 		 453 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 463 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 471 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.34 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.78 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  24.9 
 
 		 475 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  30.28 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.89 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  29.41 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.95 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.17 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  31.9 
 
 		 452 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 439 aa  97.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  26.09 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  25.99 
 
 		 442 aa  94.4  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.24 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  31.23 
 
 		 439 aa  94  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.7 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 493 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  31.83 
 
 		 407 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  25.48 
 
 		 457 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  25.48 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  25.48 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  24.95 
 
 		 460 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.39 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  25.48 
 
 		 457 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  25.88 
 
 		 479 aa  88.2  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  24.83 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  25.27 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  28.16 
 
 		 459 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.57 
 
 		 472 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 472 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  26.22 
 
 		 444 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.95 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  24.95 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  24.95 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  24.95 
 
 		 460 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  24.95 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1583  glucuronide transporter  25.71 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  24.62 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  26.74 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.89 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.74 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.13 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  24.73 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  24.73 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 495 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  25.45 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  27.34 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  25.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  26.12 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  25.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2664  hypothetical protein  26.56 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  26.12 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  26.12 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  26.12 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  25.45 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  25.98 
 
 		 482 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.28 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  22.68 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.16 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.05 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  31.11 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.61 
 
 		 471 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  31.25 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.05 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  27.08 
 
 		 469 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  22.65 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.29 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  27.08 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  26.46 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.08 
 
 		 469 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.16 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.23 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  23.53 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.54 
 
 		 476 aa  77  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  37.35 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.16 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>