80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2393 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 439 aa  825    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  97.04 
 
 		 439 aa  755    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  60.63 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  55.84 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  52.77 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  48.66 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  41.81 
 
 		 468 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  39.37 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  42.89 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  42.21 
 
 		 514 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  35.07 
 
 		 445 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  38.75 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.94 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  38.79 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.37 
 
 		 443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 472 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 461 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  33.33 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  37.78 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  39.11 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 480 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  34.38 
 
 		 405 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 506 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 461 aa  86.3  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.48 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.76 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.12 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  23.93 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 443 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  23.93 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  23.82 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  30.19 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  23.82 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.24 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  20.49 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  24.06 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  24.06 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  23.82 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  18.89 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.82 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  27 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  26.82 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  26.03 
 
 		 468 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  26.03 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  26.03 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  26.03 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  22.99 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  22.99 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  25.21 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.73 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.63 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.49 
 
 		 460 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.18 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.9 
 
 		 473 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.57 
 
 		 467 aa  46.6  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  22.57 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.57 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  22.33 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.95 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.95 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.52 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.95 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  22.66 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.91 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  28.12 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.91 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.35 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  22.91 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.22 
 
 		 460 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.07 
 
 		 445 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  24.34 
 
 		 460 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  18.97 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>