106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5882 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 445 aa  835    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  53.12 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  53.12 
 
 		 435 aa  342  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  51.67 
 
 		 452 aa  323  3e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  48.35 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  48.35 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  40.69 
 
 		 431 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  40.38 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  36.85 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 440 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  41.35 
 
 		 514 aa  169  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.26 
 
 		 436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  36.47 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  35.71 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  30.52 
 
 		 409 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  35.34 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  36.13 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.17 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 506 aa  90.5  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.86 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  22.55 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  30.12 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  24.72 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  20.4 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.88 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.1 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  22.64 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.96 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  23.74 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  23.53 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  25.3 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.4 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.8 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.78 
 
 		 444 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  20.58 
 
 		 475 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.2 
 
 		 444 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  27.44 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.61 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  27.31 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  22.48 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.3 
 
 		 460 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.63 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.01 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.6 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  30.49 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  30.49 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.95 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.95 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  39.68 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  27.23 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.67 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.4 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.4 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.39 
 
 		 465 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.4 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.01 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.78 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  32.43 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.35 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.33 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  29.01 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  29.01 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  29.01 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.67 
 
 		 465 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  25.42 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  29.01 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3419  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  25.27 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.860481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  25.65 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.38 
 
 		 467 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  25.65 
 
 		 468 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.18 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.35 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.3 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  25.18 
 
 		 468 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  29.81 
 
 		 460 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>