34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4018 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 409 aa  778    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  60.15 
 
 		 412 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  55.36 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  55.61 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  54.85 
 
 		 401 aa  302  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  40.65 
 
 		 405 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  35.87 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  36.87 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  33.66 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  34.31 
 
 		 468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  36.27 
 
 		 452 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  35.29 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  33.75 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  33.08 
 
 		 439 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 440 aa  116  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  32.32 
 
 		 514 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.79 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 468 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  30.29 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.1 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 471 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  21.66 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.49 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.86 
 
 		 465 aa  47.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2259  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  20.86 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  30.64 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.28 
 
 		 472 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>