58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0369 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 412 aa  786    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  60.15 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  62.95 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  62.69 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  61.39 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  46.27 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  39.7 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  40.21 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  34.36 
 
 		 431 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  40.05 
 
 		 435 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  33.49 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  35.96 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  37.62 
 
 		 439 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  36.67 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  34.89 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  28.92 
 
 		 436 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 464 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  22.94 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  43.95 
 
 		 514 aa  79.7  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 461 aa  73.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.05 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  30.07 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.51 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 471 aa  48.9  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.66 
 
 		 459 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  26.85 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.07 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.33 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2259  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.37 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  22.64 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  51.28 
 
 		 477 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.74 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  21.94 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  27.81 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  29.38 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  30.6 
 
 		 448 aa  43.5  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  29.46 
 
 		 453 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.32 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.32 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.32 
 
 		 441 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0047  xylose-proton symporter  28.1 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000774004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  22.41 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0047  xylose-proton symporter  28.1 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0046  xylose-proton symporter  28.1 
 
 		 457 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00338984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  30.94 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0046  xylose-proton symporter  28.1 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00152296  normal  0.141953 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.94 
 
 		 441 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  48.72 
 
 		 478 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>