65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2966 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 439 aa  825    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  97.04 
 
 		 439 aa  755    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  60.39 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  54.99 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  52.29 
 
 		 428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  48.41 
 
 		 445 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  41.57 
 
 		 468 aa  223  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  39.61 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  43.36 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  42.51 
 
 		 514 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  35.07 
 
 		 445 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 468 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  34.92 
 
 		 440 aa  147  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  32.78 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  37.78 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  37.78 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  33.82 
 
 		 409 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  25.37 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  38.39 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 506 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 480 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  32.95 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 463 aa  94.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 461 aa  83.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  25.17 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.56 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  20.39 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  19.12 
 
 		 469 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  24.17 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  24.17 
 
 		 460 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  30.19 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  25.9 
 
 		 461 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  23.7 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03711  hypothetical protein  23.93 
 
 		 468 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03762  predicted transporter  23.93 
 
 		 468 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5323  sugar transporter family protein  23.7 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  26.49 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4109  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.7 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  27 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  28.03 
 
 		 442 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  25.62 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  25.62 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  25.62 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  25.62 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.49 
 
 		 460 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.16 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  24.79 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.72 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.4 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.62 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  22.65 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  22.65 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4405  glucuronide carrier protein  22.86 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  27.68 
 
 		 462 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4340  inner membrane symporter YihP  25.08 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.48 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>