249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1545 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  100 
 
 
457 aa  887    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  32.27 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  32.1 
 
 
468 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  28.24 
 
 
443 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  28.96 
 
 
461 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  28.01 
 
 
453 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  27.53 
 
 
506 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  31.67 
 
 
471 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  29.61 
 
 
461 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  31.25 
 
 
463 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  29.56 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.98 
 
 
480 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.35 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  27.67 
 
 
445 aa  133  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  28.67 
 
 
464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  29.49 
 
 
468 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.53 
 
 
477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.92 
 
 
442 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.65 
 
 
459 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.32 
 
 
444 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.94 
 
 
460 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.19 
 
 
466 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.47 
 
 
442 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.74 
 
 
467 aa  102  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.62 
 
 
465 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.4 
 
 
441 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.53 
 
 
441 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.62 
 
 
478 aa  100  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.97 
 
 
442 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.53 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.63 
 
 
478 aa  98.2  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0162  Na+/galactoside symporter  22.22 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.26 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0167  Na+/galactoside symporter  22.97 
 
 
468 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.774115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0162  Na+/galactoside symporter  22.97 
 
 
468 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0163  Na+/galactoside symporter  22.97 
 
 
468 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0170  Na+/galactoside symporter  22.97 
 
 
468 aa  97.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.671323  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  27.6 
 
 
453 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.15 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  25.17 
 
 
486 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.01 
 
 
471 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  25.29 
 
 
442 aa  93.2  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.4 
 
 
463 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.25 
 
 
465 aa  92.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  28.25 
 
 
459 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.58 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  26.65 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.79 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.71 
 
 
482 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.71 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.2 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.83 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  24.52 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.11 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  22.33 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  22.33 
 
 
454 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.71 
 
 
476 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.59 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  24.65 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4524  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.55 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.44 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  22.37 
 
 
461 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  26.53 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25 
 
 
460 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  24.63 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  22.45 
 
 
467 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  26.71 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  42.31 
 
 
514 aa  73.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.27 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  21.89 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  23.46 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2372  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.17 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.31 
 
 
493 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4282  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.07 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.368763  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4394  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.26 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0181186  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
460 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4311  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.02 
 
 
444 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4396  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.84 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4463  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.02 
 
 
444 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.84 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.72 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.84 
 
 
552 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  22.5 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  30 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  22.83 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2997  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.54 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.738547  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  22.72 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  22.72 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  22.72 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  22.72 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  22.72 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  22.72 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.35 
 
 
544 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  22.41 
 
 
481 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  22.5 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  22.5 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  22.5 
 
 
460 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>