107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0494 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  757    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  48.96 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  46.86 
 
 		 428 aa  245  9e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  45.69 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  45.82 
 
 		 452 aa  225  9e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  42.13 
 
 		 431 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  42.31 
 
 		 468 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  40.44 
 
 		 445 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  43.92 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  43.46 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  42.92 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  37.05 
 
 		 436 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 468 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  26.9 
 
 		 443 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  37.75 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 471 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  39.8 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  40.1 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  37.4 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  41.27 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26 
 
 		 472 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  26.48 
 
 		 453 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  31.77 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  24.82 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.34 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  28.43 
 
 		 442 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.72 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.57 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  24.16 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  24.81 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14841  GPH family sugar transporter  24.24 
 
 		 449 aa  66.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  26.32 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  25.99 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.82 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.17 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  21.77 
 
 		 475 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  20.5 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1344  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  25.81 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.69 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.97 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  23.69 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  23.37 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.95 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  24.27 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  23.71 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.19 
 
 		 442 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  26 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 527 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  27.24 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06480  Na+/melibiose symporter-like transporter  23.97 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.610657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  27.24 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.26 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.04 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.74 
 
 		 472 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1527  Na+/xyloside symporter  24.03 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  28.46 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  28.46 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  28.46 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  28.46 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.65 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25 
 
 		 481 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.64 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  20.56 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.9 
 
 		 466 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  27.64 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  27.64 
 
 		 460 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.76 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.46 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  27.64 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  27.64 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  27.64 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.16 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.43 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  20.09 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  22.89 
 
 		 524 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  27.64 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.89 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.54 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.55 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.48 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>