76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0232 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  100 
 
 		 435 aa  814    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  62.09 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  61.54 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  54.99 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  55.84 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  53.94 
 
 		 445 aa  312  9e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  43.61 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 407 aa  227  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  40.94 
 
 		 468 aa  213  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  37.89 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  43.43 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  40.4 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  34.13 
 
 		 436 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  35.88 
 
 		 409 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  34.67 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 464 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  36.79 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  38.28 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  38.73 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 506 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  26.18 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  25.18 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 457 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  33.59 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5322  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter family protein  25.36 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.357419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03710  hypothetical protein  25.36 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03761  predicted transporter  25.36 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4110  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.29 
 
 		 467 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.91 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3770  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00377745  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.96 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  25.91 
 
 		 474 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4261  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.06 
 
 		 467 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4399  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter family protein  25.06 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 471 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  27.23 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  29.56 
 
 		 522 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 478 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  25.42 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.47 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 457 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.52 
 
 		 472 aa  47  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.27 
 
 		 477 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  24.27 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.44 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5276  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299294 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.29 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.33 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.31 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1593  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  20.93 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.113599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.33 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.53 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.53 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  21.57 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  18.73 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  30.06 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.84 
 
 		 447 aa  44.3  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.5 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 495 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  30.23 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  22.6 
 
 		 448 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  19.14 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>