62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2939 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  100 
 
 		 401 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  85.04 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  86.03 
 
 		 401 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  61.95 
 
 		 412 aa  381  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  54.85 
 
 		 409 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  46.87 
 
 		 405 aa  236  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  41.81 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  40.3 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 407 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  36.27 
 
 		 431 aa  159  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  37.44 
 
 		 468 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  37.95 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  38.92 
 
 		 439 aa  149  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  38.36 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  36.57 
 
 		 445 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  37.6 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  36.74 
 
 		 445 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  31.08 
 
 		 436 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 464 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.13 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  25.18 
 
 		 467 aa  53.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3372  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 457 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0546081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  32.85 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 460 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4293  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.62 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0966548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4248  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.94 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4339  putative permease  23.62 
 
 		 474 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1446  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  28.05 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  31.33 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4227  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.53 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.65 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  23.83 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  25.11 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  23.83 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  28.19 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  30.49 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.49 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  30.49 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  30.49 
 
 		 469 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  30.49 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  30.49 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  30.49 
 
 		 473 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  35.42 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  25.78 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  35.42 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  35.42 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  35.42 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  35.42 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.24 
 
 		 460 aa  43.9  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  26.87 
 
 		 460 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  26.87 
 
 		 460 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>