38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1089 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  100 
 
 		 401 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  99 
 
 		 401 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  85.04 
 
 		 401 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  62.72 
 
 		 412 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  55.61 
 
 		 409 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  47.37 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  40.61 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  41.54 
 
 		 452 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  35.32 
 
 		 431 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  36.76 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  40.41 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  38.58 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  39.38 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  34.16 
 
 		 445 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  35.57 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  30.64 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 440 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 472 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  44.67 
 
 		 514 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  21.74 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 463 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 506 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  22.91 
 
 		 467 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 481 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1421  GPH family sugar transporter  22.38 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15231  GPH family sugar transporter  22.02 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  21.62 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2095  GPH family sugar transporter  25 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  23.72 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15091  GPH family sugar transporter  21.3 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  24.44 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>