254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0726 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  100 
 
 		 468 aa  887    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  49.23 
 
 		 468 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  43.24 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1619  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  42.4 
 
 		 436 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 464 aa  259  7e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  32.35 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1893  major facilitator superfamily MFS_1  39.68 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2613  sodium:galactoside symporter family protein  35.71 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.777957  normal  0.0752663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0575  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2611  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 480 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.803344  normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0269  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.41542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0494  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.520669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1453  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2966  major facilitator superfamily transporter  36.89 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.274258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2393  major facilitator superfamily transporter  37.1 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1586  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  35.55 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1057  putative symporter protein  37.72 
 
 		 514 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.872646  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0232  sodium:galactoside symporter family protein  37.88 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6100  sodium:galactoside symporter family protein  32.88 
 
 		 431 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0503744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2614  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.106443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0466  sodium:galactoside symporter family protein  33.99 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5882  sodium:galactoside symporter family protein  35.27 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.97 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1919  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.12 
 
 		 472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0517  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.53 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.53 
 
 		 460 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.94 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.37 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.16 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0255  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 449 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  23.25 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.16 
 
 		 472 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25.9 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1545  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  27.87 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 493 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.41 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  27.31 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.07 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  26.38 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.12 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.35 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.79 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.63 
 
 		 443 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.01 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 497 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  25.64 
 
 		 511 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1647  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 495 aa  97.8  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.187163  hitchhiker  0.001175 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0679  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 439 aa  97.8  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000876885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.41 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.41 
 
 		 441 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1089  sugar/cation symporter  31.49 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  27.67 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2752  major facilitator transporter  31.57 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.955521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24.75 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.7 
 
 		 441 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4018  sodium:galactoside symporter family protein  28.17 
 
 		 409 aa  93.6  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.698144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.81 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 432 aa  93.2  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1269  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  29.63 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0410  sodium:galactoside symporter family protein  31.09 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0469682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.88 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  21.72 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.86 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.1 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 527 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  25.18 
 
 		 457 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2939  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  34.11 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0647777  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0369  putative sodium:galactoside symporter family protein  30.35 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0459  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.82 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4406  inner membrane symporter YihP  25.7 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0907861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0272  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.79 
 
 		 544 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4228  inner membrane symporter YihP  25.48 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4014  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.7 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85917  normal  0.255078 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  23.91 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2853  sugar transporter  30.24 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.563006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  23.78 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0430  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3075  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  24.72 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.818183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4400  sugar transporter family protein  25.5 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1071  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  25.98 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2191  Na+/melibiose symporter and related transporter-like protein  26.73 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.69 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4262  sugar transporter family protein  24.72 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  27.51 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.31 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3365  oligogalacturonide transporter  24.76 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.74 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  22.03 
 
 		 524 aa  80.5  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>