More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5623 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  98.38 
 
 
431 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  80.44 
 
 
433 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  92.11 
 
 
431 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  77.28 
 
 
438 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  78.97 
 
 
433 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  76.87 
 
 
440 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  92.82 
 
 
432 aa  778    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  80.66 
 
 
430 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  91.2 
 
 
432 aa  783    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  75.81 
 
 
431 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  94.66 
 
 
431 aa  813    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  92.58 
 
 
431 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  80.09 
 
 
438 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  92.58 
 
 
431 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  76.87 
 
 
440 aa  634    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  92.11 
 
 
431 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  91.42 
 
 
431 aa  790    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  100 
 
 
431 aa  856    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  77.26 
 
 
439 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  72.34 
 
 
439 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  72.75 
 
 
454 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  74.69 
 
 
425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  70.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  70.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  70.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  70.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  70.52 
 
 
434 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  67.76 
 
 
437 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  69.09 
 
 
437 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  67.54 
 
 
477 aa  588  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  67.38 
 
 
430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.37 
 
 
433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  65.94 
 
 
425 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.87 
 
 
437 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  67.23 
 
 
431 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  67.64 
 
 
431 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  65.18 
 
 
435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  65.88 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  66.11 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  66.59 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  66.11 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  65.88 
 
 
446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  66.11 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  66.67 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  66.11 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  66.11 
 
 
431 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  65.88 
 
 
431 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  65.23 
 
 
433 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  66.42 
 
 
433 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  65.38 
 
 
429 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  66.67 
 
 
433 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  65.71 
 
 
431 aa  567  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  67.78 
 
 
432 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  67.79 
 
 
430 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  65.79 
 
 
431 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  66.42 
 
 
431 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  65.79 
 
 
488 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  63.51 
 
 
433 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  65.96 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  65.96 
 
 
429 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  61.67 
 
 
440 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  61.43 
 
 
431 aa  518  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  61.61 
 
 
435 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  59.82 
 
 
437 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  56.45 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  57.36 
 
 
430 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
427 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  41.65 
 
 
425 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 
438 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
425 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  38.68 
 
 
443 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  40 
 
 
425 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  40.69 
 
 
425 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.81 
 
 
438 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  40.69 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  40.69 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  40.69 
 
 
425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  39.91 
 
 
425 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  41.65 
 
 
425 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  40.79 
 
 
427 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6354  major facilitator transporter  36.52 
 
 
442 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  37.24 
 
 
457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.86 
 
 
436 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
443 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  38.82 
 
 
436 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  37.96 
 
 
440 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  40.97 
 
 
461 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  37.96 
 
 
447 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1342  major facilitator family transporter  39.01 
 
 
425 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1266  major facilitator family transporter  39.01 
 
 
435 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  39.37 
 
 
436 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2520  major facilitator family transporter  38.77 
 
 
452 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  40.15 
 
 
425 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  38.85 
 
 
436 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.71 
 
 
435 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  40.19 
 
 
435 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  37.11 
 
 
439 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  40.19 
 
 
435 aa  275  8e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.95 
 
 
435 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>