40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1790 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  790    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  52.59 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  51.41 
 
 		 409 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 414 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 390 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  30.67 
 
 		 291 aa  93.2  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0511  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.9 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  29.37 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 401 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  30.69 
 
 		 457 aa  49.7  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0466  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 575 aa  47  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614591  normal  0.0769795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 396 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 433 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  28.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  26.96 
 
 		 469 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 538 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.34 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  29.91 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  35.48 
 
 		 463 aa  43.5  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 498 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 451 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0037  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>