15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6490 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  98.49 
 
 		 397 aa  764    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  775    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  55.05 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  54.69 
 
 		 387 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  27.15 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 396 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 410 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  25.86 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2269  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 427 aa  46.2  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000581212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>