25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2005 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  100 
 
 		 390 aa  769    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 390 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 397 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  30 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  21.91 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  21.91 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  21.98 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.34 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  32.41 
 
 		 399 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.71 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  32.41 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>