20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3895 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  96.12 
 
 		 387 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  58.56 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  54.75 
 
 		 397 aa  342  9e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  29.37 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  25.57 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2218  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464422 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.03 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.03 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>