12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4356 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  96.12 
 
 		 414 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  100 
 
 		 387 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  58.01 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  53.93 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  54.65 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 403 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 409 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 396 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  29.76 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  25.79 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>