40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1600 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  88.35 
 
 		 396 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  787    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  51.41 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  28.51 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0511  hypothetical protein  34.78 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.55 
 
 		 390 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  26.86 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  29.01 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0202  hypothetical protein  25.81 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0349216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  26.54 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0774  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2391  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1445  hypothetical protein  26.46 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  29.32 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4799  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.896954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  31.73 
 
 		 477 aa  43.1  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>