34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0202 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0349216  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  21.96 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  20.49 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  20.49 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.63 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.84 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  20.83 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.56 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.1 
 
 		 506 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  23.82 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.1 
 
 		 506 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 447 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 404 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.27 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.78 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.1 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  18.07 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 438 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 403 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>