28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1424 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  88.19 
 
 		 409 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 396 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1790  major facilitator transporter  52.59 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3895  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.943711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5737  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.328341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4356  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5849  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6490  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2116  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2005  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.065805  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0512  hypothetical protein  28.96 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0511  hypothetical protein  35.14 
 
 		 128 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.122028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  24.55 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 433 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2391  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 428 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 		 531 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>