62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2391 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2391  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  852    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0182  hypothetical protein  75.58 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4127  major facilitator transporter  59.26 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.372507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3002  major facilitator transporter  59.75 
 
 		 425 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4390  hypothetical protein  61 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4354  hypothetical protein  60.5 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.780411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4176  hypothetical protein  60.65 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.100487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4014  membrane protein  60.25 
 
 		 425 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4024  membrane protein  60.65 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.543971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4294  hypothetical protein  60.65 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000525268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4407  hypothetical protein  60.5 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0534995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4498  hypothetical protein  60.65 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0846  hypothetical protein  58.23 
 
 		 425 aa  486  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.170502 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1420  hypothetical protein  36.41 
 
 		 393 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1018  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 432 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4003  hypothetical protein  22.11 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 584 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 489 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 491 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 491 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1424  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.935376  normal  0.465976 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  29.47 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  29.47 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07112  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03920)  29.41 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  29.47 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  29.47 
 
 		 537 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.71 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  29.47 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2821  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 544 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501587 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.8 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1413  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 479 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  28.79 
 
 		 586 aa  47  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 537 aa  46.6  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 537 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.8 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4260  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1600  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1157  major facilitator family transporter  26.62 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  25.51 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 615 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.47 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 539 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.6 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.06 
 
 		 483 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.67 
 
 		 531 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.65 
 
 		 569 aa  43.5  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  25.12 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 530 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 486 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.95 
 
 		 737 aa  43.1  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>