More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0037 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0037  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 392 aa  742    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  30.91 
 
 		 507 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.03 
 
 		 477 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  26.03 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  27.76 
 
 		 497 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.7 
 
 		 480 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  24.87 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  27.01 
 
 		 492 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  25 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  25.84 
 
 		 476 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  25.06 
 
 		 468 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  24.52 
 
 		 474 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  25.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  25.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  25.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  25.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  25.32 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  25.83 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  25.32 
 
 		 465 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  23.5 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  24.31 
 
 		 466 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  28.42 
 
 		 468 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  25.33 
 
 		 458 aa  103  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  25.98 
 
 		 468 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  26.94 
 
 		 479 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  25.34 
 
 		 459 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  24.08 
 
 		 457 aa  99.8  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  26.92 
 
 		 450 aa  99.4  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  24.4 
 
 		 479 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  24.1 
 
 		 468 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  25.97 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  25.7 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  23.75 
 
 		 475 aa  96.7  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  26.81 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  23.11 
 
 		 448 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  25.24 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  22.82 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  23.28 
 
 		 485 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  25.4 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  24.01 
 
 		 471 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  24.53 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  24.76 
 
 		 486 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  22.49 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  23.83 
 
 		 468 aa  90.1  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  27.99 
 
 		 480 aa  89.7  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  23.75 
 
 		 478 aa  89.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  24.57 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  22.13 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  33.88 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  33.88 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  23.56 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  22.56 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  27.16 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  22.56 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  22.56 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  22.56 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  22.56 
 
 		 491 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  22.56 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  28.04 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  22.49 
 
 		 466 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  23.79 
 
 		 482 aa  86.3  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4538  D-xylose-proton symporter  27.13 
 
 		 264 aa  86.3  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  21.92 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  23.43 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  21.92 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  21.92 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  23.97 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03799  MFS transporter  24.88 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  24.59 
 
 		 496 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  29.47 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  24.44 
 
 		 473 aa  83.6  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  23.7 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  24.94 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  27.34 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  26.26 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  23.61 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  26.49 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  22.43 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  22.27 
 
 		 468 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  23.15 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  25.24 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  25.11 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0869  D-xylose proton-symporter  23.33 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.88 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  23.33 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  26.23 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  23.02 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  23.02 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  23.02 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  23.02 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  25.32 
 
 		 472 aa  79.7  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  23.46 
 
 		 484 aa  79.7  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>