140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4967 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  877    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  54.81 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  20.98 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  23.12 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.2 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.2 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 531 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.4 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 504 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 490 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.73 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  22.98 
 
 		 438 aa  53.5  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  18.75 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 458 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.56 
 
 		 508 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 472 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.93 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  21.18 
 
 		 472 aa  50.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.96 
 
 		 521 aa  50.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  21.89 
 
 		 506 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 481 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.35 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3797  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 524 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2166  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 481 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  20.73 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  21.48 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 548 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  22.09 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.02 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  23.04 
 
 		 454 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  26.51 
 
 		 384 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.16 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  21.34 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3668  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.56 
 
 		 411 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.4 
 
 		 495 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 463 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.26 
 
 		 609 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  28.15 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  25.62 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2711  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 476 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.182132  normal  0.33324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4120  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 411 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2415  major facilitator superfamily transporter  29.46 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468126  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0858  hypothetical protein  25.52 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.392282  normal  0.20959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.06 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.76 
 
 		 532 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.51 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  31.9 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1430  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  21.48 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0960  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.66 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.64 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  26.05 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>