65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0365 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 474 aa  953    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  89.62 
 
 		 472 aa  835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  89.38 
 
 		 471 aa  831    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  89.83 
 
 		 472 aa  835    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  89.41 
 
 		 472 aa  831    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  80 
 
 		 491 aa  752    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  95.57 
 
 		 495 aa  910    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  84.36 
 
 		 476 aa  789    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  95.36 
 
 		 474 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  94.94 
 
 		 474 aa  907    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  71.49 
 
 		 482 aa  635    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 461 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  32.07 
 
 		 461 aa  187  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  32.73 
 
 		 440 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  26.57 
 
 		 490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 457 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 531 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 445 aa  96.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 482 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.09 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  26.05 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  20.05 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.32 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  21.7 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.23 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 446 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 415 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 387 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4976  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.554715 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  19.78 
 
 		 433 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 438 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 424 aa  43.5  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 386 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>