41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0494 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  100 
 
 		 442 aa  847    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  62.25 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 450 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  45.27 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  51.29 
 
 		 442 aa  362  8e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  48.31 
 
 		 437 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  48.98 
 
 		 438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  44.78 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 413 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  37.75 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  34.94 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  32.33 
 
 		 384 aa  162  9e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  35.96 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 391 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 440 aa  77.8  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  24.33 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  23.92 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  24.36 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  24.05 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  24.78 
 
 		 491 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  22.94 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  21.16 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  20.65 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>