31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2061 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  100 
 
 
442 aa  860    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  74.15 
 
 
450 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  52.07 
 
 
438 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  53.13 
 
 
437 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  51.64 
 
 
442 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  48.93 
 
 
446 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  45.25 
 
 
413 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  45.64 
 
 
438 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  42.89 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  41.91 
 
 
454 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  34.96 
 
 
384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  35.62 
 
 
377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  36.1 
 
 
430 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
405 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.46 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
391 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.88 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  25.36 
 
 
431 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  25.91 
 
 
440 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  21.48 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  25.06 
 
 
431 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  19.67 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 
476 aa  57  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
421 aa  53.5  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.79 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
439 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  26.8 
 
 
482 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  26.16 
 
 
421 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.25 
 
 
440 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  21.51 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>