19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02419 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  100 
 
 		 384 aa  757    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  43.54 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 413 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  32.76 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 450 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 442 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  32.59 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 446 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  32.61 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  30.98 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  30.81 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  22.19 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  22.72 
 
 		 405 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 440 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>