18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4143 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 377 aa  750    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  43.54 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  36.48 
 
 		 437 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  38.44 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  32.8 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  34.07 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  31.55 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 391 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>