18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0259 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  875    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  43.79 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  37.22 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  41.91 
 
 		 442 aa  262  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  41.18 
 
 		 437 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  45.33 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 446 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  36.5 
 
 		 439 aa  183  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  33.7 
 
 		 377 aa  160  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  31.57 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>