21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2837 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  867    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  53.92 
 
 
450 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  46.01 
 
 
438 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  53.13 
 
 
442 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  48.3 
 
 
442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  48.42 
 
 
446 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  41.95 
 
 
413 aa  306  6e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  43 
 
 
438 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  39.85 
 
 
439 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  40.51 
 
 
454 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  38.27 
 
 
377 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  33.5 
 
 
384 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  37.1 
 
 
430 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  26.34 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
391 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  25.46 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.9 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  21.77 
 
 
406 aa  51.6  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  25.3 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>