76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3349 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  100 
 
 
441 aa  863    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  36.68 
 
 
419 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 
405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  30.02 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  30.67 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  27.86 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
433 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
423 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  27.96 
 
 
437 aa  119  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
421 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  28.48 
 
 
431 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  24.62 
 
 
402 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  29 
 
 
431 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  27.2 
 
 
442 aa  96.7  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  27.76 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  23.06 
 
 
415 aa  87.8  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  21.6 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  22.82 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  23.97 
 
 
446 aa  84.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  25.42 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  20.75 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  24.83 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  23.99 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  24.19 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  27.33 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  24.42 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.89 
 
 
470 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.31 
 
 
504 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 
513 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
457 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  24.6 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  25.5 
 
 
454 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  24.03 
 
 
413 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  22.19 
 
 
384 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  24.61 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  22.33 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  25.46 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.96 
 
 
398 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.32 
 
 
407 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  21.58 
 
 
409 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.8 
 
 
491 aa  50.8  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
462 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  23.78 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  24.05 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  24.53 
 
 
454 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.31 
 
 
476 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  23.73 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  23.29 
 
 
377 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 
453 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  23.78 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  23.16 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
406 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4648  hypothetical protein  22.83 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000315706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0601  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
406 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  33.64 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.12 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  23.39 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.18 
 
 
482 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 
445 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.83 
 
 
480 aa  44.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
380 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  26.39 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  23.12 
 
 
495 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  25.81 
 
 
461 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.99 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.1 
 
 
444 aa  43.5  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25.86 
 
 
409 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  21.4 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.89 
 
 
440 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>