42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2583 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  802    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  22.37 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  21.72 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  19.95 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  20.81 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 427 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 471 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  19.41 
 
 		 450 aa  45.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  22.68 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  25 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 480 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  21.4 
 
 		 446 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 459 aa  43.1  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  25.11 
 
 		 425 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>