19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4068 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 439 aa  853    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 442 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 446 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  37.68 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 450 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  38.69 
 
 		 437 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  35.81 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  31.92 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4143  major facilitator superfamily permease  32.53 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  32.18 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 504 aa  46.6  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>