61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1194 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  792    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  68.73 
 
 		 391 aa  521  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 419 aa  277  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 433 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  25.41 
 
 		 438 aa  90.9  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 442 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1073  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  hitchhiker  0.0000455445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2061  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310539 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  22.4 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0364  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.877458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  25.26 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2462  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4068  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.200514  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  26.48 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 495 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  21.98 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  25.75 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  26.12 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 504 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  26.18 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2837  hypothetical protein  28.05 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  20.97 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22060  hypothetical protein  27.08 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.104249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02419  permease of the major facilitator superfamily  22.72 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 445 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3472  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0259  hypothetical protein  24.3 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 531 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 411 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 389 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 395 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 412 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>