61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2034 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  100 
 
 		 504 aa  1003    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  40.76 
 
 		 462 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 446 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 513 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  26.97 
 
 		 397 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  28.12 
 
 		 461 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 459 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  26.54 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 450 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  26.46 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  25.18 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  24.27 
 
 		 468 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  25.19 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  25.24 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  25.24 
 
 		 474 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 454 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  24.08 
 
 		 413 aa  86.7  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  24.1 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  20.72 
 
 		 457 aa  80.1  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  21.52 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  20.33 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 391 aa  67  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 440 aa  57  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 431 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 420 aa  47.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0707  hypothetical protein  21.9 
 
 		 771 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0380006  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>